概要

2023 年 iGEM TokyoTech の 3D-PCR モデルに使用するコードたち

docker-compose up --build

で jupyterlab が立ち上がるので，そこで動かしてください．

ディレクトリ構成

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├── Dockerfile
├── README.md
├── data
├── docker-compose.yaml
└── notebooks
    ├── evaluation.ipynb
    ├── solver_binary.ipynb
    └── solver_continuous.ipynb

• evaluation.ipynb では，arrangement する場合としない場合の比較をしている(データ生成は指数分布に従う)
• solver_binary.ipynb では，positive か negative になる確率が binary で与えられている場合を考えている
• solver_continuous.ipynb では，positive か negative になる確率が指数分布で与えられる場合を考えている