构建、运行并持续改进自己的多 Agent 科研工作流，让工作流本身也能演化。
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项目总览 · 运行监控 · Workflow 编排
ScienceEvolve 是论文 Rethinking Scientific Discovery in the Agentic Era 中的自主科研框架，将研究、实验、编码和评审连接成可视化工作流。你可以组建自己的 Agent 团队，查看真实执行轨迹，让团队根据评估反馈改进任务，也可以授权 Main 调整工作流本身。
🧩 ScienceEvolve 的两种使用方式 — 同一套工作流语义，按你的工作方式选择入口。
— Web / Server 仓库。在网页中编排 Agent、连接模型网关、管理研究项目，查看轨迹与交付文件。
— SDK / CLI 仓库。通过 TypeScript 或命令行运行工作流，将研究流程接入自己的代码与服务。参见 SDK 示例与 Web / SDK 功能边界。
“这里有一个泊松方程求解器。请探索两种改进方案，验证收敛性，比较误差，并整理成报告。”
在画布中连接计划、并行探索、实现和评审。Main 负责协调任务与确认完成，Worker 负责研究、实验、编码和评审等具体工作；每个 Agent 可独立选择 Codex、Claude Code、DSH 或 pi，并配置模型、提示词、Skills 与 MCP 工具。
任务循环：执行任务 → 获取真实反馈 → 改进方法 → 再次执行。流程循环：回看研究结果 → 调整 Agent 分工、工具或连接关系 → 用更新后的工作流继续研究。你可以从固定工作流开始，按需要开启流程演化。
Evolver 就在研究团队中。 当前实现由获得动态重配置授权的 Main 承担这一职责。Main 提交 workflow.json 并调用 apply_workflow，Server 校验后应用；研究方法是否因此变好，仍要用实际任务评估。
了解 Main / Worker 分工与双循环 · 查看动态重配置范围
获得授权后，Main 可以增删 Agent、调整职责和路径、切换 Harness，并提交新的工作流。Server 校验通过后再应用；团队可根据当前任务重新分工。查看配置范围。
Main 发起有限元网格收敛实验，Coder → Executor → Review 整组运行 3 轮后，退出到用户指定的 Writer，由其交付误差评估报告（errors.md）。轮数与退出 Agent 均可配置。
Idea 将增大仿真时间步长的方案交给 Execution。候选变更集成后评分下降，接手的 Review 直接用 Git 撤销该变更，恢复已接受的代码并复验；撤销形成新提交，原提交与失败实验保留。
启用 Git 协作后，Agent 在独立 worktree 中完成修改，使用协作组组织并行探索，再通过评审与逐级 Pull Request 集成结果。配置 GitHub 账号。
System Runtime 保存项目状态、已完成进度和执行轨迹。可恢复的中断经恢复后继续推进评审与交付；涉及外部作业时，先核对实际进程与结果。
通过 Project Explainer 解释当前流程、编辑 Agent 配置、添加循环与协作组。运行中修改经过工作流更新机制应用，并保留服务端接受的版本。
875 个 Skill · 12 个研究领域 · 从 7 万余篇已发表论文中提炼。
ScienceEvolve 内置一套科研方法技能库，覆盖假设生成、研究设计、实验验证、证据分析与迭代。为 Agent 配置职责、模型和工具的同时，也可以选择与课题相关的领域方法。
每个 Skill 都包含适用场景、所需输入、研究步骤、预期输出、验证条件、结论边界和失败处理。工作流组织团队协作，Skill 则帮助每个成员具体开展科学研究。
| 研究领域 | 技能数 |
|---|---|
| 抗体与免疫识别 | 111 |
| 水系电池界面 | 92 |
| 不对称催化 | 38 |
| 染色质与表观基因组调控 | 39 |
| 量子材料与凝聚态 | 232 |
| 纤维复合材料与电池材料 | 121 |
| 星系、宇宙学与模拟 | 57 |
| 磁约束聚变 | 28 |
| 神经形态计算与伊辛优化 | 41 |
| 有机金属催化与 DFT | 25 |
| 聚合物复合材料与类玻璃高分子 | 60 |
| 城市灾害韧性 | 31 |
| 合计 | 875 |
展开查看一个 Skill：不对称催化研究设计
手性催化剂研究设计 Skill 引导 Agent 完成：
定义研究问题 → 提出竞争假设 → 设计最小验证 → 分析证据 → 迭代或调整方向。
它要求提供目标转化、已有证据、候选机制与可用分析手段，并在各阶段设置判断条件：证据无法区分假设时，重新设计验证；观测与机制不符时，修正假设。输出包括研究计划、对照、判定标准及有证据支持的结论边界。
网页端使用： 在工作流中选中 Agent，通过现有 Skills 入口添加相关技能，按需要选择固定加载或由支持该能力的 Harness 自动选择。技能随项目提供，无需另行下载。
Main 获得工作流动态调整权限后，也可以随研究进展调整 Skill 配置。具体数据、工具与实际实验环境仍按课题配置。
准备 Node.js 24+、npm 10+、已安装的 Inspire CLI，以及一个可用的模型网关。当前 Server 启动时会检查 Inspire，本地任务也需要能找到该 CLI。
从仓库页面的 Code → HTTPS 复制克隆地址，替换下面的 REPOSITORY_URL：
git clone REPOSITORY_URL ScienceEvolve
cd ScienceEvolve
npm ci
npm ci --prefix harness/codex
cp .env.example .env使用默认 ./data 时，将 .env 中的 SCIENCEEVOLVE_INSPIRE_WORKSPACE_ROOT 改为仓库的绝对路径。Inspire 不在 PATH 中时，设置 SCIENCEEVOLVE_INSPIRE_BIN 为可执行文件的绝对路径。更新已有安装时保留原来的 .env。
npm run dev打开工作台 http://127.0.0.1:5173；API 健康检查应返回包含 "status":"ok" 的 JSON。其他 Harness、环境变量和部署方式见安装与配置指南。
打开 “全局网关库”，填写模型服务的 HTTPS 地址和 API key，选择协议与可用模型，保存并设为默认网关。点击 “测试连接”，在 Harness/model 矩阵中验证将要使用的组合。每个 Agent 的模型和思考选项都应与该网关实际支持的选项一致。
仓库的 example/ 保留 Workflow JSON、需求与参考资源，应用不自动加载这些流程。先在运行 Server 的机器上手动导出一个网页导入副本：
node example/export-web-workflow.mjs \
example/02-software-development/workflow.json /tmp/software.web.json在主页点击 “导入 SDK workflow.json”，选择生成的文件并预览；关闭预览后，在 “快速发起研究任务 → Agent 配置预设” 中选择导入项。粘贴软件任务需求，为每个 Agent 配置可用的 Harness、网关与模型，保持并行协作关闭，点击 “提交并继续”。
项目完成后检查最终代码、使用说明及 development/final.md 中的实际测试记录。完整手动导入步骤见下面的折叠教程；SDK 运行方式见 SDK 使用指南。
通过通用 JSON 导入、Workflow 画布、Agent 属性面板与 Project Explainer，将自己的需求配置为可执行流程。先跑通一个小任务，再按需要加入 Loop、并行协作与流程演化。
① 跑通一个真实项目：构建并测试 Node.js Todo CLI
- 按上面的命令，将原始 Workflow导出为单独的
software.web.json。脚本补齐网页格式、移除顶层部署字段，并解析 Skill 路径；原文件不变，需求仍单独保存。输出文件已存在时换一个文件名。 - 在主页点击 “导入 SDK workflow.json”，选择导出的文件。导入后打开原文只读画布；检查 coding、testing 与 Main 的职责，然后关闭预览。
- 在 “快速发起研究任务 → Agent 配置预设” 下拉框中选择刚导入的流程，载入可编辑副本。将 requirement.txt 的内容复制到 “研究任务需求”，保留
add / list / done / remove、JSON 持久化、损坏文件保护和错误退出码等验收要求。 - 如果要上传已有代码，先在快速发起中 “保存 → 另存为新配置”，然后进入 “新建项目” 选择该配置，通过 “补充文件与图片” → “选择文件或图片 / 选择文件夹” 上传。输入文件保存在项目的
user_inputs/；新建页使用 “创建并启动研究” 启动。
下图是通过通用导入入口打开的实际只读画布，尚未连接模型或启动研究。关闭预览并在快速发起中选择导入项后，点击 “打开 Workflow 画布编辑器” 编辑副本。
用户输入 → coding → testing → 通过：完成
↑ │
└─ 失败 ─┘
Main：协调异常恢复与用户补充输入
- 点击 coding 或 testing，在 “Agent 属性面板” 中检查 Harness、全局网关、model、网关思考强度。Main 也需要有效配置；模板中的模型名称不会自动变成你有权使用的模型。
- coding → testing 是强边；testing 根据真实测试结果选择修复或完成。testing 是本例指定的终止 Agent，并显式允许自动完成。画出通往结束的线，并不会直接判定任务成功。
- 本例使用条件重试，没有固定轮数的 Loop。暂时保持并行协作和 Main 自动调整 Workflow 关闭。按 “保存流程” 返回，并按需另存配置；导入原文保持只读。
- “推荐配置” 是可选的辅助工具。载入指定方法后，如果使用推荐或 Project Explainer 修改流程，应再次检查角色、路径和验收条件。
在主页点击 “提交并继续”，在项目页查看 coding 的实现、testing 的独立测试及失败交接。如果改从新建页启动，则点击 “创建并启动研究”；“保存课题” 只保存草稿。
预期交付是可运行的 cli.mjs、Node 内置测试用例、使用说明，以及 development/ 中的各轮测试证据和 final.md。测试应使用临时目录与 TODO_DATA_FILE，覆盖持久化、空输入、重复 done、未知 ID、损坏 JSON 和非法参数。只有当前版本的必测用例真实通过，才能结束；请以本次运行的实际文件和命令记录验收。
遇到可恢复的中断，先查看项目状态、失败原因与已有轨迹，再使用 “暂停项目” / “启动项目”；中断项目会提供 “启动并恢复”。恢复保留已完成进度，但外部实验或工具进程需要核对真实状态后再继续。
② 编排自己的 Workflow：Agent、强弱边、Loop、协作组与运行中调整
在 “Agent 模板” 中选择模板并添加副本，点击节点编辑职责、Agent 指令、Harness、模型、Skills 和 MCP。Main 是唯一且必需的协调 Agent，不能删除或重命名；新增 Worker 后需要自行连接业务路径。Main 的固定调度边由系统维护。
模型网关、已安装 Harness、Skills 文件和 MCP 服务都必须实际可用。任务文件通过网页上传；需要 GPU、实验平台或湿实验的流程，先按对应例子的前提准备外部资源。
从节点端口拖出连线，或在属性面板中选择 “连接目标” → “添加连接”：
| 编排项 | 应如何使用 |
|---|---|
| 强边 | 当前 Agent 完成后直接进入唯一目标；不能同时混入其他出边候选。 |
| 弱边 | 提供多个候选去向，由配置的 Main 或当前 Worker 决策；失败回修、分支选择适合这种路径。 |
| 终止节点 | 默认由 Main 验收；非 Main 终止 Agent 只有显式获准自动完成且处于合法上下文时，才能提交完成。验收条件应写清实际证据。 |
按相同的手动导出与导入步骤，载入 AHE · 代码自进化，可看到 optimizer → execute → judge → optimizer 的强边闭环。合法闭环会建立 Loop，无需另加一个 Loop 节点。点击任意成员边，在右侧设置 Loop ID、每批迭代数和退出目标。
本例的配置为：
{
"id": "code_evolution",
"from": "judge",
"to": "optimizer",
"maxIterations": 3,
"exitTo": "main"
}这表示一批最多 3 轮，批次结束交给 Main。Main 按原目标判断交付，或回到 optimizer 开始下一批；它不是整个项目只运行 3 轮。from → exitTo 的虚线是只读批次出口，不会每轮都执行。暂停、恢复和失败重试保留 batch、iteration、total 计数；打断闭环会移除对应 Loop。
先配置 “GitHub 账号”，再启用 “并行协作模式” 并新建协作组。选择已有 Agent 作为 Leader，引用其他 Agent 作为组内业务节点；点击组进入内部 Workflow，使用面包屑或 “返回父图” 返回。只有组入口发出的边会创建并行路径，组内仍可使用强弱边、Loop 和嵌套协作组。
同一 Agent 在多个位置引用时共享配置、会话和目录，调用按队列串行；不同 Agent 可并行执行。“结束协作组”需要等待必要路径与 Git 集成，逐级 PR 合并及本地同步完成后才推进后续节点。具体配置见 Git 账号与协作和协作组内 Workflow。
使用 “智能整理 / 分层重排 / 适应画布” 检查全图。保存时可选择 “更新当前配置 / 仅本次项目使用 / 另存为新配置”；导入原文只读，修改另存为自己的配置。
Project Explainer 可辅助编辑草稿、解释流程并提交允许范围内的运行中调整。若希望 Main 自主改变编排，创建前开启 “允许 Main 动态重配置（高级权限）”；Main 只能在获授权的轮次提交 workflow.json，并通过 apply_workflow 校验应用。凭据、运行权限、会话与思考策略、授权开关等仍锁定；已接受的 Skill/MCP 内容不可同名覆盖，修改内容需新增定义并更新引用。
运行中以服务端已接受的配置和实际轨迹为准；暂停、提交调整和恢复是不同动作。完整可编辑范围见 Workflow 配置，助手使用方式见 Project Explainer。
我们参考公开论文与开源项目，将其中的 Agent 分工、任务路径与反馈循环编排为 ScienceEvolve Workflow。感谢原作者开放方法和代码；下面的表格同时提供原始来源、官方项目与我们的实现。
本页展示 21 个工作流示例，其中 3 个适合入门，对应文件见 example/。它们以 JSON 配置、参考资源与说明文档的形式提供；Web 端由用户自行复制、导出和导入，不设置专门的模板展示区，也不自动加载或随 Server 打包。
软件开发与测试 — 编码、独立测试、失败回修。 · AHE · 代码自进化 — 执行、评分、优化与批间裁决。 · 默认科研工作流 — 构思、执行、写作、评审与 Main 协调。
† Google AI co-scientist 与 ScientistTwo 按公开论文及可用组件独立实现；固定来源未提供完整官方系统源码。autoresearch 的固定来源为官方项目；AgentRxiv 的代码包含在 Agent Laboratory 仓库中。各例说明列出具体来源版本、适配范围与工具条件。
本表收录的是 workflow 结构与编排的实现或适配，不以论文实验或指标的复现作为收录条件。各例说明提供方法映射与工具要求，详见来源与适配范围。
查看真实 Workflow 画布：软件开发与测试 / AHE 代码自进化
以下是通过现有通用 JSON 导入入口打开的实际前端截图，仅展示配置，未连接模型或运行研究。
软件开发与测试 — coding 实现，testing 独立验收，失败回修。
AHE 代码自进化 — 执行、评分、优化闭环，每批 3 轮后返回 Main 判断。
查看完整 example 目录 · 了解来源、协议与验证范围
前端与服务端共用 .agents/skills 中的内置技能。对应上游开源仓库及使用关系如下。
| 内置 Skill / 资源 | 上游开源仓库 | 在 ScienceEvolve 中的使用 |
|---|---|---|
ccf-common、ccf-experiment-designer、ccf-idea-optimizer、ccf-idea-reviewer、ccf-literature-monitor、ccf-literature-searcher、ccf-paper-reviewer、ccf-paper-to-exemplar、ccf-paper-writer、ccf-visual-composer | mikubaka88/CCFA-Skills | 适配科研、写作、评审与可视化技能。 |
nature-figure、nature-polishing、nature-shared、nature-writing | Yuan1z0825/nature-skills | 集成 Nature 风格写作、润色、绘图及共享参考资料。 |
awesome-ai-research-writing-director | Leey21/awesome-ai-research-writing | 综合写作方法，并适配论文正文输出合同。 |
inspire | realZillionX/InspireSkill | 集成启智平台操作知识，并适配 SII MCP。 |
nature-figure 使用的绘图参考 | ChenLiu-1996/figures4papers | 科研图设计与绘图方法参考。 |
内置版本包含 ScienceEvolve 的集成调整。项目角色技能 research-director、idea-agent、experiment-runner、latex-writer 和 iclr-reviewer 随本仓库维护。感谢上游作者与贡献者。
CCFA 与 Nature 的内置副本未记录导入时的提交版本；上游仓库归属通过比对 Skill 名称与内容确认。
| 你要完成的事 | 对应指南 |
|---|---|
| 安装、修改端口和数据目录、部署服务 | 安装与环境 · 服务环境 · 生产运行 |
| 接入模型服务、选择协议和验证组合 | 全局网关 |
| 安装其他 Harness、调整单个 Agent | Harness · Agent 参数 · 运行时说明 |
| 连接工具、添加项目级资源 | Skills 与 MCP · Inspire / SII 实验 |
| 设置 GitHub OAuth、并行与嵌套协作 | Git 账号配置 · 协作组内 Workflow |
| 查看编排、权限、恢复与宿主差异 | Workflow · 系统架构 · Web / SDK 边界 |
| 文档 | 链接 |
|---|---|
| 研究工作流说明 | Main / Worker 分工、双循环与方法来源 |
| SDK 文档 | SDK 使用指南 · SDK 示例 |
| Workflow 文件与手动导入 | 示例目录与导入说明 |
| Workflow 画布截图 | 21 张真实 Workflow 画布 |
| Inspire CLI 安装 | 安装与配置说明 |