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VincentBellavance committed Mar 17, 2023
1 parent ee1f54f commit e52abff
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42 changes: 22 additions & 20 deletions docs/environmental_variables.html
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<title>Identification des habitats potentiels des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent - Variables environnementales à considérer pour les modèles</title>
<title>Identification des habitats potentiels des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent - Variables environnementales</title>
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<h1 class="quarto-secondary-nav-title">Variables environnementales à considérer pour les modèles</h1>
<h1 class="quarto-secondary-nav-title">Variables environnementales</h1>
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Expand Down Expand Up @@ -123,7 +123,7 @@ <h1 class="quarto-secondary-nav-title">Variables environnementales à considére
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<a href="./environmental_variables.html" class="sidebar-item-text sidebar-link active">Variables environnementales à considérer pour les modèles</a>
<a href="./environmental_variables.html" class="sidebar-item-text sidebar-link active">Variables environnementales</a>
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Expand All @@ -143,7 +143,7 @@ <h1 class="quarto-secondary-nav-title">Variables environnementales à considére
</li>
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<a href="./species_distribution_modelling.html" class="sidebar-item-text sidebar-link">Modèles de distribution d'espèce</a>
<a href="./species_distribution_modelling.html" class="sidebar-item-text sidebar-link">Modèles de distribution d'espèces</a>
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Expand Down Expand Up @@ -184,7 +184,7 @@ <h2 id="toc-title">Table of contents</h2>

<header id="title-block-header" class="quarto-title-block default">
<div class="quarto-title">
<h1 class="title d-none d-lg-block">Variables environnementales à considérer pour les modèles</h1>
<h1 class="title d-none d-lg-block">Variables environnementales</h1>
</div>


Expand All @@ -201,7 +201,7 @@ <h1 class="title d-none d-lg-block">Variables environnementales à considérer p

<section id="connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-de-mer" class="level2 page-columns page-full">
<h2 class="anchored" data-anchor-id="connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-de-mer">Connaissances sur les habitats des plumes de mer</h2>
<p>Les connaissances sur les habitats des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent sont limitées à ce jour. Les travaux de <span class="citation" data-cites="kenchington2016">Kenchington et al. (<a href="references.html#ref-kenchington2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span> ont permis de délimiter des zones d’importance pour les plumes de mer avec la méthode du noyau dans le golfe du Saint-Laurent. Ces zones où la concentration de plumes de mer est particulièrement élevée se situent le long du Chenal Laurentien <a href="#fig-zones-sea-pens">Figure&nbsp;<span>1</span></a>.</p>
<p>Les connaissances sur les habitats des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent sont limitées à ce jour. Les travaux de <span class="citation" data-cites="kenchington2016">Kenchington et al. (<a href="references.html#ref-kenchington2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span> ont permis de délimiter des zones d’importance pour les plumes de mer avec la méthode du noyau dans le golfe du Saint-Laurent. Ces zones où la concentration de plumes de mer est particulièrement élevée se situent le long du chenal Laurentien <a href="#fig-zones-sea-pens">Figure&nbsp;<span>1</span></a>.</p>
<div id="fig-zones-sea-pens" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full">
<p><img src="figures/sea_pens_areas.png" class="img-fluid figure-img"></p>
Expand Down Expand Up @@ -231,41 +231,43 @@ <h2 class="anchored" data-anchor-id="connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-d
<tbody>
<tr class="odd">
<td><span class="citation" data-cites="gullage2017">Gullage, Devillers, and Edinger (<a href="references.html#ref-gullage2017" role="doc-biblioref">2017</a>)</span></td>
<td></td>
<td>- <em>Distichophyllum gracile</em> <br> - <em>Funiculina quadrangularis</em> <br> - <em>Halipteris finmarchica</em> <br> - <em>Pennatula grandis</em> <br> - <em>Pennatula aculeata</em> <br> - <em>Pennatula</em> spp. <br> - <em>Umbellula lindahli</em> <br> - <em>Anthoptilum grandiflorum</em></td>
<td>Plates-formes de Terre-Neuve et du Labrador</td>
<td></td>
<td>- Profondeur <br> - Température des eaux de fond</td>
</tr>
<tr class="even">
<td><span class="citation" data-cites="yesson2012">Yesson et al. (<a href="references.html#ref-yesson2012" role="doc-biblioref">2012</a>)</span></td>
<td></td>
<td>- Sessiliflorae <br> - Subselliflorae</td>
<td>Global</td>
<td></td>
<td>- Température des eaux de fond <br> - Productivité primaire des eaux de surface <br> - Horizons de saturation en calcite <br> - Salinité des eaux de fond</td>
</tr>
<tr class="odd">
<td><span class="citation" data-cites="greathead2015">Greathead et al. (<a href="references.html#ref-greathead2015" role="doc-biblioref">2015</a>)</span></td>
<td></td>
<td>- <em>Funiculina quadrangularis</em> <br> - <em>Virgularia mirabilis</em> <br> - <em>Pennatula phosphorea</em></td>
<td>Royaume-Uni</td>
<td></td>
<td>- Sédiments <br> - Salinité minimale des eaux de fond <br> - Profondeur</td>
</tr>
<tr class="even">
<td><span class="citation" data-cites="downie2021">Downie et al. (<a href="references.html#ref-downie2021" role="doc-biblioref">2021</a>)</span></td>
<td></td>
<td>- <em>Funiculina quadrangularis</em> <br> - <em>Virgularia mirabilis</em> <br> - <em>Pennatula phosphorea</em></td>
<td>Royaume-Uni</td>
<td></td>
<td>- Température des eaux de fond <br> - Vélocité du courant et des vagues <br> - Concentration de particules en suspension en hiver</td>
</tr>
<tr class="odd">
<td><span class="citation" data-cites="ross2021">Ross et al. (<a href="references.html#ref-ross2021" role="doc-biblioref">2021</a>)</span></td>
<td></td>
<td>- <em>Funiculina quadrangularis</em> <br> - <em>Halipteris</em> spp. <br> - <em>Kophobelemnon stelliferum</em> <br> - <em>Pennatulidae</em> spp. <br> - <em>Umbellula</em> spp. <br> - <em>Virgulariidae</em> spp.</td>
<td>Norvège</td>
<td></td>
<td>- Profondeur <br> - Interaction Température-Salinité <br> - Sédiments <br> - Pente <br> - Vélocité maximale du courant <br> - Biomasse de carbone du phytoplancton</td>
</tr>
</tbody>
</table>
</div>
</section>
<section id="listes-des-variables-environnementales-présentées" class="level2">
<h2 class="anchored" data-anchor-id="listes-des-variables-environnementales-présentées">Listes des variables environnementales présentées</h2>
<p>En raison de l’état des connaissances relativement limitée sur les habitats des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent, il est préférable d’explorer un grand nombre de covariables avant de commencer la modélisation afin d’éviter d’exclure une covariable potentiellement importante dès le départ. Les prochaines sections présentent les 61 covariables intégrées jusqu’à présent pour modéliser les habitats potentiels des plumes de mer. Il est important de noter que cette liste n’est pas exhaustive et que d’autres covariables pourraient être ajoutées à cette liste éventuellement. Les données présentées proviennent de Pêches et Océans Canada ainsi que de Bio-Oracle. Les données ont toutes été projetées sur une grille de 36 secondes d’arc de résolution, à l’exception des données de sédiments puisqu’elles sont sous forme de polygones.</p>
<p>En raison de l’état des connaissances relativement limitée sur les habitats des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent, il est préférable d’explorer un grand nombre de variables environnementales avant de commencer la modélisation afin d’éviter d’exclure une variable potentiellement importante dès le départ. Les prochaines sections présentent les 61 covariables intégrées jusqu’à présent pour modéliser les habitats potentiels des plumes de mer.</p>
<p>Les données présentées proviennent de Pêches et Océans Canada ainsi que de Bio-Oracle. Les données ont toutes été projetées sur une grille de 36 secondes d’arc de résolution, à l’exception des données de sédiments puisqu’elles sont sous forme de polygones.</p>
<p>Il est important de noter que cette liste n’est pas exhaustive et que d’autres covariables pourraient être ajoutées à cette liste éventuellement.</p>
<section id="fonds-marins" class="level3">
<h3 class="anchored" data-anchor-id="fonds-marins">Fonds marins</h3>
<ul>
Expand All @@ -274,8 +276,8 @@ <h3 class="anchored" data-anchor-id="fonds-marins">Fonds marins</h3>
<li><p>Salinité des eaux de fond</p></li>
<li><p>Température des eaux de fond</p></li>
<li><p>Vitesse du courant</p></li>
<li><p>Biomasse de phytoplankton et concentration de chlorophylle a</p></li>
<li><p>Molécules et éléments dissous dans l’eau</p></li>
<li><p>Biomasse de phytoplancton et concentration de chlorophylle a</p></li>
<li><p>Concentration de molécules et éléments dissous dans les eaux de fond</p></li>
<li><p>Sédiments</p></li>
<li><p>Données sur la pêche commerciale</p></li>
</ul>
Expand All @@ -284,7 +286,7 @@ <h3 class="anchored" data-anchor-id="fonds-marins">Fonds marins</h3>
<h3 class="anchored" data-anchor-id="eaux-de-surface">Eaux de surface</h3>
<ul>
<li><p>Couvert glacier</p></li>
<li><p>Biomasse de phytoplankton, concentration de chlorophylle a et productivité primaire</p></li>
<li><p>Biomasse de phytoplancton, concentration de chlorophylle a et productivité primaire</p></li>
<li><p>Calcite dissous dans les eaux de surface</p></li>
</ul>

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