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VincentBellavance committed Mar 17, 2023
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18 changes: 9 additions & 9 deletions docs/environmental_variables.html
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Expand Up @@ -201,19 +201,19 @@ <h1 class="title d-none d-lg-block">Variables environnementales</h1>

<section id="connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-de-mer" class="level2 page-columns page-full">
<h2 class="anchored" data-anchor-id="connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-de-mer">Connaissances sur les habitats des plumes de mer</h2>
<p>Les connaissances sur les habitats des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent sont limitées à ce jour. Les travaux de <span class="citation" data-cites="kenchington2016">Kenchington et al. (<a href="references.html#ref-kenchington2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span> ont permis de délimiter des zones d’importance pour les plumes de mer avec la méthode du noyau dans le golfe du Saint-Laurent. Ces zones où la concentration de plumes de mer est particulièrement élevée se situent le long du chenal Laurentien <a href="#fig-zones-sea-pens">Figure&nbsp;<span>1</span></a>.</p>
<p>Les connaissances sur les habitats des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent sont limitées à ce jour. Les travaux de <span class="citation" data-cites="kenchington2016">Kenchington et al. (<a href="references.html#ref-kenchington2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span> ont permis de délimiter des zones d’importance pour les plumes de mer avec la méthode du noyau dans le golfe du Saint-Laurent. Ces zones, où la concentration de plumes de mer est particulièrement élevée, se situent le long du chenal Laurentien <a href="#fig-zones-sea-pens">Figure&nbsp;<span>1</span></a>.</p>
<div id="fig-zones-sea-pens" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full">
<p><img src="figures/sea_pens_areas.png" class="img-fluid figure-img"></p>
<p></p><figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;1: Zones de concentration significative de plumes de mer dans le golfe du Saint-Laurent identifiées par <span class="citation" data-cites="kenchington2016">Kenchington et al. (<a href="references.html#ref-kenchington2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span></figcaption><p></p>
</figure>
</div>
<p>Ces polygones ont été complémentés par des modèles de distribution des plumes de mer dans le golfe du Saint-Laurent réalisés par <span class="citation" data-cites="murillo2016">Murillo et al. (<a href="references.html#ref-murillo2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span>. Les modèles basés sur des arbres décisionnels ont permis d’identifier la salinité et la température des eaux de fond ainsi que la profondeur comme étant les covariables les plus importantes pour la prédiction de la présence des plumes de mer <span class="citation" data-cites="murillo2016">(<a href="references.html#ref-murillo2016" role="doc-biblioref">Murillo et al. 2016</a>)</span>. La productivité primaire et la température des eaux de surface sont quant à elles les deux covariables les plus importantes à la prédiction de la biomasse des plumes de mer <span class="citation" data-cites="murillo2016">(<a href="references.html#ref-murillo2016" role="doc-biblioref">Murillo et al. 2016</a>)</span>.</p>
<p>D’autres modèles de distribution des plumes de mer ont été réalisés pour complémenter les travaux de <span class="citation" data-cites="kenchington2016">Kenchington et al. (<a href="references.html#ref-kenchington2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span>. Ces modèles visent la région des Maritimes <span class="citation" data-cites="beazley2016a">(<a href="references.html#ref-beazley2016a" role="doc-biblioref">Beazley, Kenchington, et al. 2016</a>)</span>, les plates-formes de Terre-Neuve et du Labrador <span class="citation" data-cites="guijarro2016">(<a href="references.html#ref-guijarro2016" role="doc-biblioref">Guijarro et al. 2016</a>)</span> et l’est de l’Arctique <span class="citation" data-cites="beazley2016b">(<a href="references.html#ref-beazley2016b" role="doc-biblioref">Beazley, Murillo, et al. 2016</a>)</span>. La profondeur est une variable importante à la prédiction de la présence des plumes de mer dans ces trois régions <span class="citation" data-cites="beazley2016a beazley2016b guijarro2016">(<a href="references.html#ref-beazley2016a" role="doc-biblioref">Beazley, Kenchington, et al. 2016</a>; <a href="references.html#ref-beazley2016b" role="doc-biblioref">Beazley, Murillo, et al. 2016</a>; <a href="references.html#ref-guijarro2016" role="doc-biblioref">Guijarro et al. 2016</a>)</span>, alors que l’étendue des valeurs de la salinité des eaux de fond s’est également avérée importante pour le modèle dans l’est de l’Arctique&nbsp;<span class="citation" data-cites="guijarro2016">(<a href="references.html#ref-guijarro2016" role="doc-biblioref">Guijarro et al. 2016</a>)</span>.</p>
<p>Nous nous sommes également fiés sur d’autres études portant sur la distribution et les habitats des plumes de mer ailleurs dans le monde afin d’élaborer la liste de covariables à prendre en considération pour les modèles. La <a href="#tbl-studies">Table&nbsp;<span>1</span></a> présente un résumé de ces études avec les taxons visés, l’aire d’étude et les covariables les plus importantes pour la prédiction de la présence des plumes de mer.</p>
<p>Ces polygones ont été complémentés par des modèles de distribution des plumes de mer dans le golfe du Saint-Laurent réalisés par <span class="citation" data-cites="murillo2016">Murillo et al. (<a href="references.html#ref-murillo2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span>. Les modèles basés sur des arbres décisionnels ont permis d’identifier la salinité et la température des eaux de fond ainsi que la profondeur comme étant les variables environnementales les plus importantes pour la prédiction de la présence des plumes de mer <span class="citation" data-cites="murillo2016">(<a href="references.html#ref-murillo2016" role="doc-biblioref">Murillo et al. 2016</a>)</span>. La productivité primaire et la température des eaux de surface sont quant à elles les deux variables environnementales les plus importantes pour la prédiction de la biomasse des plumes de mer <span class="citation" data-cites="murillo2016">(<a href="references.html#ref-murillo2016" role="doc-biblioref">Murillo et al. 2016</a>)</span>.</p>
<p>D’autres modèles de distribution des plumes de mer ont été réalisés pour complémenter les travaux de <span class="citation" data-cites="kenchington2016">Kenchington et al. (<a href="references.html#ref-kenchington2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span>. Ces modèles visent la région des Maritimes <span class="citation" data-cites="beazley2016a">(<a href="references.html#ref-beazley2016a" role="doc-biblioref">Beazley, Kenchington, et al. 2016</a>)</span>, les plates-formes de Terre-Neuve et du Labrador <span class="citation" data-cites="guijarro2016">(<a href="references.html#ref-guijarro2016" role="doc-biblioref">Guijarro et al. 2016</a>)</span> et l’est de l’Arctique <span class="citation" data-cites="beazley2016b">(<a href="references.html#ref-beazley2016b" role="doc-biblioref">Beazley, Murillo, et al. 2016</a>)</span>. La profondeur est une variable importante pour la prédiction de la présence des plumes de mer dans ces trois régions <span class="citation" data-cites="beazley2016a beazley2016b guijarro2016">(<a href="references.html#ref-beazley2016a" role="doc-biblioref">Beazley, Kenchington, et al. 2016</a>; <a href="references.html#ref-beazley2016b" role="doc-biblioref">Beazley, Murillo, et al. 2016</a>; <a href="references.html#ref-guijarro2016" role="doc-biblioref">Guijarro et al. 2016</a>)</span>, alors que l’étendue des valeurs de la salinité des eaux de fond s’est également avérée importante pour le modèle dans l’est de l’Arctique&nbsp;<span class="citation" data-cites="guijarro2016">(<a href="references.html#ref-guijarro2016" role="doc-biblioref">Guijarro et al. 2016</a>)</span>.</p>
<p>Nous nous sommes également fiés sur d’autres études portant sur la distribution et les habitats des plumes de mer ailleurs dans le monde afin d’élaborer la liste de variables à prendre en considération pour les modèles. La <a href="#tbl-studies">Table&nbsp;<span>1</span></a> présente un résumé de ces études avec les taxons visés, l’aire d’étude et les variables les plus importantes pour la prédiction de la présence des plumes de mer.</p>
<div id="tbl-studies" class="anchored">
<table class="table">
<caption>Table&nbsp;1: Covariables les plus importantes pour la prédiction de la présence des plumes de mer selon cinq études aillant modélisé leurs distributions</caption>
<caption>Table&nbsp;1: Variables environnementales les plus importantes pour la prédiction de la présence des plumes de mer selon cinq études aillant modélisé leurs distributions</caption>
<colgroup>
<col style="width: 16%">
<col style="width: 29%">
Expand All @@ -225,7 +225,7 @@ <h2 class="anchored" data-anchor-id="connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-d
<th>Études</th>
<th>Taxons visés</th>
<th>Aires d’étude</th>
<th>Covariables</th>
<th>Variables</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
Expand All @@ -238,7 +238,7 @@ <h2 class="anchored" data-anchor-id="connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-d
<tr class="even">
<td><span class="citation" data-cites="yesson2012">Yesson et al. (<a href="references.html#ref-yesson2012" role="doc-biblioref">2012</a>)</span></td>
<td>- Sessiliflorae <br> - Subselliflorae</td>
<td>Global</td>
<td>Globale</td>
<td>- Température des eaux de fond <br> - Productivité primaire des eaux de surface <br> - Horizons de saturation en calcite <br> - Salinité des eaux de fond</td>
</tr>
<tr class="odd">
Expand All @@ -265,9 +265,9 @@ <h2 class="anchored" data-anchor-id="connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-d
</section>
<section id="listes-des-variables-environnementales-présentées" class="level2">
<h2 class="anchored" data-anchor-id="listes-des-variables-environnementales-présentées">Listes des variables environnementales présentées</h2>
<p>En raison de l’état des connaissances relativement limitée sur les habitats des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent, il est préférable d’explorer un grand nombre de variables environnementales avant de commencer la modélisation afin d’éviter d’exclure une variable potentiellement importante dès le départ. Les prochaines sections présentent les 61 covariables intégrées jusqu’à présent pour modéliser les habitats potentiels des plumes de mer.</p>
<p>En raison de l’état des connaissances relativement limitée sur les habitats des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent, il est préférable d’explorer un grand nombre de variables environnementales avant de commencer la modélisation afin d’éviter d’exclure une variable potentiellement importante dès le départ. Les prochaines sections présentent les 61 variables intégrées jusqu’à présent pour modéliser les habitats potentiels des plumes de mer.</p>
<p>Les données présentées proviennent de Pêches et Océans Canada ainsi que de Bio-Oracle. Les données ont toutes été projetées sur une grille de 36 secondes d’arc de résolution, à l’exception des données de sédiments puisqu’elles sont sous forme de polygones.</p>
<p>Il est important de noter que cette liste n’est pas exhaustive et que d’autres covariables pourraient être ajoutées à cette liste éventuellement.</p>
<p>Il est important de noter que cette liste n’est pas exhaustive et que d’autres variables pourraient y être ajoutées éventuellement.</p>
<section id="fonds-marins" class="level3">
<h3 class="anchored" data-anchor-id="fonds-marins">Fonds marins</h3>
<ul>
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