数据的输入

[Niohuruzh]

您好，我想通过TO-GCN了解不同时间点，野生型和敲除株的时序基因共表达网络，我是否一定需要提供TF的文件？因为我想试图通过TO-GCN了解所有的基因表达情况。
另外，时间点是否需要均等？
期待您的回复
祝好！

[petitmingchang]

@Niohuruzh 由於 TO-GCN 的概念是基於TF間的調控關係而建立的，所以只使用 TF 來建立的 TO-GCN 才有意義。如果你想要了解所有基因的表達，可以在 TO-GCN 建立之後再計算所有 TF 與 non-TF 之間的 coexpression 關係 (by step 2: GCN)。
此外，時間點不需要均等。

[Niohuruzh]

非常感谢您的回复！