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[statnmap]

• Combine occurrence at sea and abundance class in basins
• Filter on Species only

[statnmap]

• INRAE envoie la liste des espèces active: champ "species" dans la table
• INRAE propose la requete SQL pour extraire ces données en mer (et qui prend switch (rectangle or area) + id_espece en entrée) et sort la geom + occurence (chiffre).
• INRAE doit choisir si on présente la carte par rectangle ou par area sur l'UI => Les deux avec un bouton pour choisir
• INRAE propose la requete SQL pour extraire les données des bassins (et qui prend lang + id_espece en entrée) et sort la geom + les classes d'abondances traduites dans la langue + id_classe numérique pour savoir l'ordre (faible => forte)
• INRAE nous fournit le script des cartes {tmap} à partir des colonnes de la table
• ThinkR doit indiquer le temps d'affichage pour savoir s'il est nécessaire d'avoir une géométrie simplifiée des 'area'
• ThinkR filtre sur les espèces actives

[statnmap]

• Bouton "Conservation status" => Une colonne dans la table
• Bouton "Source" => A retirer
• Bouton "Division / Rectangle" => Switch entre 2 modes de carte => colonne "voccurence

Pour obtenir les geom, on fera une jointure via gid & ices_type. (gid est l’identifiant spatial).

Clé d’entrée : Filter fish_name == input$species, ices_type == input$rectangle_or_division, ensuite jointure avec la table des geom via gid & ices_type. On a toutes les geom, mais possible que un fish_name n’aient pas de geom dans certains cas. On part donc de la table geom et on faire une jointure pour avoir tous les geom ( right_join(espece_filtered, table_des_geom) ) .

Que faire quand c’est vide, remplacer par zéro ? => va être géré par Eric

En terre : division ou rectangle

v_abundance => Select species_id, jointure via basin_id avec basin_outlet

=> Eric : Revoir les labels de la carte, “Not recorded in the period”

[statnmap]

Code tmap pour les cartes: https://gitlab.irstea.fr/diades/diades.atlas.data/-/tree/master/scripts_R

[ColinFay]

Implémentation ok, une fois les PR associées mergées

[statnmap]

Contenu de la page validé en réunion du 2021-11-26.
une issue ouverte: #67