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git教程.md

File metadata and controls

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代码版本控制是作为程序员，必须要考虑的问题，针对Rstudio可以利用Github进行版本控，下面对整个操作过程进行说明：

设定目录

在windows系统下，选择Tools --> Global Options，然后选择Git/SVN，选择Git executable，所以安装前提是你要有先安装Git，如下图所示

image-20210329122736942

选择git目录

然后Create RSA Key

image-20210329122752182

image-20210329122816918

image-20210329122840750

打开Tools，选择shell，输入命令： git config --global user.email "[email protected] git config --global user.name "yourname" ssh -T [email protected] 使用GitHub上的名字

image-20210329122854117GitHub连接

新建一个一个工程

新建一个工程，选择New Directory

image-20210329122906337

新建工程

然后勾选Create a git repository

image-20210329122936787

创建Git

这个时候Rstudio会出现git栏，提交到本地，只需要在git栏下面点击commit，即可提交至本地

image-20210329122958635GitHub提交

可以将代码保存至GitHub上，并且创建分支，在GitHub上创建一个New respository，命名为test

image-20210329123014956

GitHUb上创建

打开Rstudio中的Shell窗口，输入git命令

git remote rm origin
git remote add origin  https://github.com/cystone/advancedSingleCell.git
git config remote.origin.url git@github.com:cystone/advancedSingleCell.git
git pull  origin master
git push  origin master

将origin重新定向 git remote set-url origin https://github.com/chengfeifan/test.git

在本地新建一个GitHub上已经存在的项目

首先在Rstudio上新建一个project，选择version control,然后选Clone Git Respository，将GitHub上repository的url加入到选项中

image-20210329123033548

Paste_Image.png

然后在shell窗口输入 git config remote.origin.url [email protected]:ewenharrison/test.git

git中设置上游

在git的时候，我们会建立许多有特性的分支，建立分支的时候，如何使得远端也出现分支，需要用到下面的命令：

 git push --set-upstream origin master

常见错误和解决办法

$git push fatal: unable to access 'https://github.com/cystone/advancedSingleCell.git/': LibreSSL SSL_connect: SSL_ERROR_SYSCALL in connection to github.com:443

git config --global --unset http.proxy
git config --global http.sslVerify false

如果有如下： Enter passphrase for key '～/.ssh/id_rsa':

ssh-add ~/.ssh/id_rsa