-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 9
/
Copy pathgeojson-parse.c
1631 lines (1320 loc) · 58.4 KB
/
geojson-parse.c
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
#include <R.h>
#include <Rinternals.h>
#include <Rdefines.h>
#include <R_ext/Connections.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <unistd.h>
#include <zlib.h>
#include "yyjson.h"
#include "R-yyjson-parse.h"
#define SF_POINT 1 << 1
#define SF_MULTIPOINT 1 << 2
#define SF_LINESTRING 1 << 3
#define SF_MULTILINESTRING 1 << 4
#define SF_POLYGON 1 << 5
#define SF_MULTIPOLYGON 1 << 6
#define SF_FEATURE_COLLECTION 1 << 7
#define SF_GEOMETRY_COLLECTION 1 << 8
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Make a CRS string to match what is done by: geojsonsf::geojson_sf()
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP make_crs(void) {
SEXP crs_ = PROTECT(allocVector(VECSXP, 2));
SEXP nms_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 2));
SET_STRING_ELT(nms_, 0, mkChar("input"));
SET_STRING_ELT(nms_, 1, mkChar("wkt"));
setAttrib(crs_, R_NamesSymbol, nms_);
setAttrib(crs_, R_ClassSymbol, mkString("crs"));
SET_VECTOR_ELT(crs_, 0, mkString("4326"));
SET_VECTOR_ELT(crs_, 1, mkString("GEOGCS[\"WGS 84\",\n DATUM[\"WGS_1984\",\n SPHEROID[\"WGS 84\",6378137,298.257223563,\n AUTHORITY[\"EPSG\",\"7030\"]],\n AUTHORITY[\"EPSG\",\"6326\"]],\n PRIMEM[\"Greenwich\",0,\n AUTHORITY[\"EPSG\",\"8901\"]],\n UNIT[\"degree\",0.0174532925199433,\n AUTHORITY[\"EPSG\",\"9122\"]],\n AXIS[\"Latitude\",NORTH],\n AXIS[\"Longitude\",EAST],\n AUTHORITY[\"EPSG\",\"4326\"]]"));
UNPROTECT(2);
return crs_;
}
#define SF_TYPE 1 // data.frame
#define SFC_TYPE 2 // list
#define PROP_TYPE_LIST 0
#define PROP_TYPE_STRING 1
#define PROP_LGL_AS_STR 0
#define PROP_LGL_AS_INT 1
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// GeoJSON Parse options
// - this also contains state information i.e.
// - current bounding box accumulations
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
typedef struct {
bool property_promotion;
bool property_promotion_lgl; // When promoting properties to string, should lgl be '1' or 'TRUE"?
unsigned int type;
unsigned int yyjson_read_flag;
parse_options *parse_opt;
double xmin;
double ymin;
double xmax;
double ymax;
double zmin;
double zmax;
double mmin;
double mmax;
} geo_parse_options;
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Initialise geo_parse_opts from an R named list from the user
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
geo_parse_options create_geo_parse_options(SEXP geo_opts_) {
geo_parse_options opt = {
.property_promotion = PROP_TYPE_STRING, // emulate 'geojsonsf' behaviour
.property_promotion_lgl = PROP_LGL_AS_INT, // emulate 'geojsonsf' behaviour
.type = SF_TYPE,
.yyjson_read_flag = 0,
.xmin = INFINITY,
.ymin = INFINITY,
.xmax = -INFINITY,
.ymax = -INFINITY,
.zmin = INFINITY,
.zmax = -INFINITY,
.mmin = INFINITY,
.mmax = -INFINITY
};
if (isNull(geo_opts_) || length(geo_opts_) == 0) {
return opt;
}
if (!isNewList(geo_opts_)) {
error("'geo_opts_' must be a list");
}
SEXP nms_ = getAttrib(geo_opts_, R_NamesSymbol);
if (isNull(nms_)) {
error("'geo_opts_' must be a named list");
}
for (int i = 0; i < length(geo_opts_); i++) {
const char *opt_name = CHAR(STRING_ELT(nms_, i));
SEXP val_ = VECTOR_ELT(geo_opts_, i);
if (strcmp(opt_name, "property_promotion") == 0) {
const char *val = CHAR(STRING_ELT(val_, 0));
opt.property_promotion = strcmp(val, "string") == 0 ? PROP_TYPE_STRING : PROP_TYPE_LIST;
} else if (strcmp(opt_name, "property_promotion_lgl") == 0) {
const char *val = CHAR(STRING_ELT(val_, 0));
opt.property_promotion_lgl = strcmp(val, "string") == 0 ? PROP_LGL_AS_STR : PROP_LGL_AS_INT;
} else if (strcmp(opt_name, "type") == 0) {
const char *val = CHAR(STRING_ELT(val_, 0));
opt.type = strcmp(val, "sf") == 0 ? SF_TYPE : SFC_TYPE;
} else {
warning("opt_geojson_read(): Unknown option ignored: '%s'\n", opt_name);
}
}
return opt;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// reset the bounding box in 'opt'
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
void reset_bbox(geo_parse_options *opt) {
opt->xmin = INFINITY;
opt->ymin = INFINITY;
opt->xmax = -INFINITY;
opt->ymax = -INFINITY;
opt->zmin = INFINITY;
opt->zmax = -INFINITY;
opt->mmin = INFINITY;
opt->mmax = -INFINITY;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Make an R bbox object based upon the current bbox in 'opt'
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP make_bbox(geo_parse_options *opt) {
int nprotect = 0;
SEXP bbox_ = PROTECT(allocVector(REALSXP, 4)); nprotect++;
REAL(bbox_)[0] = R_FINITE(opt->xmin) ? opt->xmin : NA_REAL;
REAL(bbox_)[1] = R_FINITE(opt->ymin) ? opt->ymin : NA_REAL;
REAL(bbox_)[2] = R_FINITE(opt->xmax) ? opt->xmax : NA_REAL;
REAL(bbox_)[3] = R_FINITE(opt->ymax) ? opt->ymax : NA_REAL;
SEXP bbox_nms_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 4)); nprotect++;
SET_STRING_ELT(bbox_nms_, 0, mkChar("xmin"));
SET_STRING_ELT(bbox_nms_, 1, mkChar("ymin"));
SET_STRING_ELT(bbox_nms_, 2, mkChar("xmax"));
SET_STRING_ELT(bbox_nms_, 3, mkChar("ymax"));
setAttrib(bbox_, R_NamesSymbol, bbox_nms_);
setAttrib(bbox_, R_ClassSymbol, mkString("bbox"));
UNPROTECT(nprotect);
return bbox_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Make a z-range object
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP make_z_range(geo_parse_options *opt) {
int nprotect = 0;
SEXP z_range_ = PROTECT(allocVector(REALSXP, 2)); nprotect++;
REAL(z_range_)[0] = R_FINITE(opt->zmin) ? opt->zmin : NA_REAL;
REAL(z_range_)[1] = R_FINITE(opt->zmax) ? opt->zmax : NA_REAL;
SEXP z_range_nms_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 2)); nprotect++;
SET_STRING_ELT(z_range_nms_, 0, mkChar("zmin"));
SET_STRING_ELT(z_range_nms_, 1, mkChar("zmax"));
setAttrib(z_range_, R_NamesSymbol, z_range_nms_);
setAttrib(z_range_, R_ClassSymbol, mkString("z_range"));
UNPROTECT(nprotect);
return z_range_;
}
bool needs_z_range(geo_parse_options *opt) {
return R_FINITE(opt->zmin) &&
R_FINITE(opt->zmax) &&
opt->zmin != NA_REAL &&
opt->zmax != NA_REAL
;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Make a z-range object
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP make_m_range(geo_parse_options *opt) {
int nprotect = 0;
SEXP m_range_ = PROTECT(allocVector(REALSXP, 2)); nprotect++;
REAL(m_range_)[0] = R_FINITE(opt->mmin) ? opt->mmin : NA_REAL;
REAL(m_range_)[1] = R_FINITE(opt->mmax) ? opt->mmax : NA_REAL;
SEXP m_range_nms_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 2)); nprotect++;
SET_STRING_ELT(m_range_nms_, 0, mkChar("mmin"));
SET_STRING_ELT(m_range_nms_, 1, mkChar("mmax"));
setAttrib(m_range_, R_NamesSymbol, m_range_nms_);
setAttrib(m_range_, R_ClassSymbol, mkString("m_range"));
UNPROTECT(nprotect);
return m_range_;
}
bool needs_m_range(geo_parse_options *opt) {
return R_FINITE(opt->mmin);
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Forward Declarations
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP geojson_as_sf(yyjson_val *val, geo_parse_options *opt, unsigned int depth);
#define COORD_XY 2
#define COORD_XYZ 3
#define COORD_XYZM 4
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Determine if the coords in this array of coordinate arrays is
// XY, XYZ or XYZM
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
unsigned int calc_matrix_coord_type(yyjson_val *arr, geo_parse_options *opt) {
unsigned int coord_bitset = 0;
unsigned int coord_type = COORD_XY;
yyjson_arr_iter row_iter = yyjson_arr_iter_with(arr);
yyjson_val *row;
while ((row = yyjson_arr_iter_next(&row_iter))) {
size_t ncoords = yyjson_get_len(row);
coord_bitset |= (1 << ncoords);
}
if (coord_bitset & (1 << 4)) {
coord_type = COORD_XYZM;
} else if (coord_bitset & (1 << 3)) {
coord_type = COORD_XYZ;
} else {
coord_type = COORD_XY;
}
return coord_type;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// ### #
// # # #
// # ### ### # ## ## # ###
// # # # # # ## # # ## #
// # # # # # # # # ###
// # # # # # # # # ## #
// ### ### ### # ## # ####
//
// Parse a JSON []-array of coordinates to a matrix.
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP parse_coords_as_matrix(yyjson_val *arr, unsigned int coord_type, geo_parse_options *opt) {
size_t nrows = yyjson_get_len(arr);
size_t ncols = coord_type;
size_t N = nrows * ncols;
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Allocate memory for the R-matrix
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP mat_ = PROTECT(allocVector(REALSXP, (R_xlen_t)N));
double *ptr = REAL(mat_);
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Iterate over nested JSON []-arrays to populate the R-matrix
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
yyjson_arr_iter row_iter = yyjson_arr_iter_with(arr);
yyjson_val *row;
unsigned int row_idx = 0;
while ((row = yyjson_arr_iter_next(&row_iter))) {
yyjson_arr_iter col_iter = yyjson_arr_iter_with(row);
yyjson_val *val;
unsigned int col_idx = 0;
while((val = yyjson_arr_iter_next(&col_iter))) {
double tmp = yyjson_get_num(val);
ptr[row_idx + col_idx * nrows] = tmp;
if (col_idx == 0) {
if (tmp > opt->xmax) opt->xmax = tmp;
if (tmp < opt->xmin) opt->xmin = tmp;
} else if (col_idx == 1) {
if (tmp > opt->ymax) opt->ymax = tmp;
if (tmp < opt->ymin) opt->ymin = tmp;
} else if (col_idx == 2) {
if (tmp > opt->zmax) opt->zmax = tmp;
if (tmp < opt->zmin) opt->zmin = tmp;
if (tmp == NA_REAL) {
opt->zmax = NA_REAL;
opt->zmin = NA_REAL;
}
} else if (col_idx == 3) {
if (tmp > opt->mmax) opt->mmax = tmp;
if (tmp < opt->mmin) opt->mmin = tmp;
}
col_idx++;
}
for (; col_idx < coord_type; col_idx++) {
ptr[row_idx + col_idx * nrows] = NA_REAL;
}
row_idx++;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Dims
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP dims_ = PROTECT(allocVector(INTSXP, 2));
INTEGER(dims_)[0] = (int)nrows;
INTEGER(dims_)[1] = (int)ncols;
setAttrib(mat_, R_DimSymbol, dims_);
UNPROTECT(2);
return mat_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Parse multiple matrices into a list
// Used for polygon and multipolygon
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP parse_coords_as_matrix_list(yyjson_val *arr,
unsigned int *accumulated_coord_type,
geo_parse_options *opt) {
size_t nrings = yyjson_get_len(arr);
SEXP ll_ = PROTECT(allocVector(VECSXP, (R_xlen_t)nrings));
yyjson_arr_iter ring_iter = yyjson_arr_iter_with(arr);
yyjson_val *coords;
unsigned int ring_idx = 0;
unsigned int coord_type = COORD_XY;
while ((coords = yyjson_arr_iter_next(&ring_iter))) {
coord_type = calc_matrix_coord_type(coords, opt);
SEXP mat_ = PROTECT(parse_coords_as_matrix(coords, coord_type, opt));
SET_VECTOR_ELT(ll_, ring_idx, mat_);
UNPROTECT(1);
ring_idx++;
}
*accumulated_coord_type = coord_type;
UNPROTECT(1);
return ll_;
}
static char *COORD_SYSTEM[5] = {"NA", "NA", "XY", "XYZ", "XYZM"};
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// ### #
// # # #
// # ### ### ## # ### #### # ## # #
// # # # # # # # # # # # ## # # #
// # ## ##### # # # # # ##### # # # ##
// # # # # # # # # # # # # ## #
// ### ### ### # # ### ## # #
// # #
// ###
//
// Point
// MultiPoint
// LineString
// MultiLineString
// Polygon
// MultiPolygon
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP parse_point(yyjson_val *obj, geo_parse_options *opt) {
// Rprintf(">> Point\n");
yyjson_val *coords = yyjson_obj_get(obj, "coordinates");
size_t N = yyjson_get_len(coords);
SEXP vec_ = PROTECT(allocVector(REALSXP, (R_xlen_t)N));
double *ptr = REAL(vec_);
yyjson_arr_iter iter = yyjson_arr_iter_with(coords);
yyjson_val *val;
unsigned int idx = 0;
while ((val = yyjson_arr_iter_next(&iter))) {
ptr[idx] = yyjson_get_num(val);
// XY bounding box
if (idx == 0) {
if (ptr[idx] > opt->xmax) opt->xmax = ptr[idx];
if (ptr[idx] < opt->xmin) opt->xmin = ptr[idx];
} else if (idx == 1) {
if (ptr[idx] > opt->ymax) opt->ymax = ptr[idx];
if (ptr[idx] < opt->ymin) opt->ymin = ptr[idx];
} else if (idx == 2) {
if (ptr[idx] > opt->zmax) opt->zmax = ptr[idx];
if (ptr[idx] < opt->zmin) opt->zmin = ptr[idx];
if (ptr[idx] == NA_REAL) {
opt->zmax = NA_REAL;
opt->zmin = NA_REAL;
}
} else if (idx == 3) {
if (ptr[idx] > opt->mmax) opt->mmax = ptr[idx];
if (ptr[idx] < opt->mmin) opt->mmin = ptr[idx];
}
idx++;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Class
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP nms_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 3));
SET_STRING_ELT(nms_, 0, mkChar(COORD_SYSTEM[N]));
SET_STRING_ELT(nms_, 1, mkChar("POINT"));
SET_STRING_ELT(nms_, 2, mkChar("sfg"));
setAttrib(vec_, R_ClassSymbol, nms_);
UNPROTECT(2);
return vec_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Multipoint
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP parse_multipoint(yyjson_val *obj, geo_parse_options *opt) {
// Rprintf(">> Point\n");
yyjson_val *coords = yyjson_obj_get(obj, "coordinates");
unsigned int coord_type = calc_matrix_coord_type(coords, opt);
// Rprintf("Multipoint %i\n", coord_type);
SEXP mat_ = PROTECT(parse_coords_as_matrix(coords, coord_type, opt));
SEXP nms_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 3));
SET_STRING_ELT(nms_, 0, mkChar(COORD_SYSTEM[coord_type]));
SET_STRING_ELT(nms_, 1, mkChar("MULTIPOINT"));
SET_STRING_ELT(nms_, 2, mkChar("sfg"));
setAttrib(mat_, R_ClassSymbol, nms_);
UNPROTECT(2);
return mat_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// LINESTRING
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP parse_linestring(yyjson_val *obj, geo_parse_options *opt) {
yyjson_val *coords = yyjson_obj_get(obj, "coordinates");
unsigned int coord_type = calc_matrix_coord_type(coords, opt);
SEXP mat_ = PROTECT(parse_coords_as_matrix(coords, coord_type, opt));
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Class
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP nms_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 3));
SET_STRING_ELT(nms_, 0, mkChar(COORD_SYSTEM[coord_type]));
SET_STRING_ELT(nms_, 1, mkChar("LINESTRING"));
SET_STRING_ELT(nms_, 2, mkChar("sfg"));
setAttrib(mat_, R_ClassSymbol, nms_);
UNPROTECT(2);
return mat_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// MULTILINESTRING
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP parse_multilinestring(yyjson_val *obj, geo_parse_options *opt) {
yyjson_val *linestrings = yyjson_obj_get(obj, "coordinates");
size_t nlinestrings = yyjson_get_len(linestrings);
SEXP ll_ = PROTECT(allocVector(VECSXP, (R_xlen_t)nlinestrings));
yyjson_arr_iter ring_iter = yyjson_arr_iter_with(linestrings);
yyjson_val *coords;
unsigned int ring_idx = 0;
unsigned int coord_type = COORD_XY;
while ((coords = yyjson_arr_iter_next(&ring_iter))) {
coord_type = calc_matrix_coord_type(coords, opt);
SEXP mat_ = PROTECT(parse_coords_as_matrix(coords, coord_type, opt));
SET_VECTOR_ELT(ll_, ring_idx, mat_);
UNPROTECT(1);
ring_idx++;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Class
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP nms_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 3));
SET_STRING_ELT(nms_, 0, mkChar(COORD_SYSTEM[coord_type]));
SET_STRING_ELT(nms_, 1, mkChar("MULTILINESTRING"));
SET_STRING_ELT(nms_, 2, mkChar("sfg"));
setAttrib(ll_, R_ClassSymbol, nms_);
UNPROTECT(2);
return ll_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Polygon
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP parse_polygon(yyjson_val *obj, geo_parse_options *opt) {
yyjson_val *coords = yyjson_obj_get(obj, "coordinates");
unsigned int coord_type = COORD_XY;
SEXP ll_ = PROTECT(parse_coords_as_matrix_list(coords, &coord_type,
opt));
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Class
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP nms_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 3));
SET_STRING_ELT(nms_, 0, mkChar(COORD_SYSTEM[coord_type]));
SET_STRING_ELT(nms_, 1, mkChar("POLYGON"));
SET_STRING_ELT(nms_, 2, mkChar("sfg"));
setAttrib(ll_, R_ClassSymbol, nms_);
UNPROTECT(2);
return ll_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// MultiPolygon
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP parse_multipolygon(yyjson_val *obj, geo_parse_options *opt) {
yyjson_val *polygons = yyjson_obj_get(obj, "coordinates");
size_t npolygons = yyjson_get_len(polygons);
SEXP ll_ = PROTECT(allocVector(VECSXP, (R_xlen_t)npolygons));
yyjson_arr_iter ring_iter = yyjson_arr_iter_with(polygons);
yyjson_val *coords;
unsigned int polygon_idx = 0;
unsigned int coord_type = COORD_XY;
while ((coords = yyjson_arr_iter_next(&ring_iter))) {
SEXP inner_ = PROTECT(parse_coords_as_matrix_list(coords, &coord_type,
opt));
SET_VECTOR_ELT(ll_, polygon_idx, inner_);
UNPROTECT(1);
polygon_idx++;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Class
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP nms_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 3));
SET_STRING_ELT(nms_, 0, mkChar(COORD_SYSTEM[coord_type]));
SET_STRING_ELT(nms_, 1, mkChar("MULTIPOLYGON"));
SET_STRING_ELT(nms_, 2, mkChar("sfg"));
setAttrib(ll_, R_ClassSymbol, nms_);
UNPROTECT(2);
return ll_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// #### # #
// # # #
// # # # ## ### # ## ### # ## #### ## ### ###
// #### ## # # # ## # # # ## # # # # # #
// # # # # ## # ##### # # # ##### ###
// # # # # # ## # # # # # # #
// # # ### # ### # ## ### ### ####
// #
// #
//
// Parse a scalar feature that is not part of a collection
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
//
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP prop_to_rchar(yyjson_val *prop_val, geo_parse_options *opt) {
if (prop_val == NULL) {
return NA_STRING;
}
char buf[128] = "";
static char *bool_str[2] = {"FALSE", "TRUE"};
static char *bool_int[2] = {"0", "1"};
switch (yyjson_get_type(prop_val)) {
case YYJSON_TYPE_NULL:
return NA_STRING;
break;
case YYJSON_TYPE_STR:
return mkChar(yyjson_get_str(prop_val));
break;
case YYJSON_TYPE_BOOL:
{
if (opt->property_promotion_lgl == PROP_LGL_AS_INT) {
int tmp = yyjson_get_bool(prop_val);
return mkChar(bool_int[tmp]);
} else {
int tmp = yyjson_get_bool(prop_val);
return mkChar(bool_str[tmp]);
}
}
break;
case YYJSON_TYPE_ARR:
case YYJSON_TYPE_OBJ:
{
yyjson_mut_doc *doc = yyjson_mut_doc_new(NULL);
yyjson_mut_val *val = yyjson_val_mut_copy(doc, prop_val);
yyjson_mut_doc_set_root(doc, val);
char *json = yyjson_mut_write(doc, 0, NULL);
if (json == NULL) {
error("Error converting json to string in prop_to_strsxp");
}
SEXP res_ = PROTECT(mkChar(json));
free(json);
yyjson_mut_doc_free(doc);
UNPROTECT(1);
return res_;
}
break;
case YYJSON_TYPE_NUM:
switch(yyjson_get_subtype(prop_val)) {
case YYJSON_SUBTYPE_UINT:
#if defined(__APPLE__) || defined(_WIN32)
snprintf(buf, 128, "%llu", yyjson_get_uint(prop_val));
#else
snprintf(buf, 128, "%lu", yyjson_get_uint(prop_val));
#endif
return mkChar(buf);
break;
case YYJSON_SUBTYPE_SINT:
#if defined(__APPLE__) || defined(_WIN32)
snprintf(buf, 128, "%lld", yyjson_get_sint(prop_val));
#else
snprintf(buf, 128, "%ld", yyjson_get_sint(prop_val));
#endif
return mkChar(buf);
break;
case YYJSON_SUBTYPE_REAL:
snprintf(buf, 128, "%f", yyjson_get_real(prop_val));
return mkChar(buf);
break;
default:
warning("prop_to_strsxp unhandled numeric type %s\n", yyjson_get_type_desc(prop_val));
}
break;
default:
warning("prop_to_strsxp unhandled type: %s\n", yyjson_get_type_desc(prop_val));
return NA_STRING;
}
Rprintf("Ugh\n");
return NA_STRING;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Parse a property as a character string from a feature collection
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP prop_to_strsxp(yyjson_val *features, char *prop_name, geo_parse_options *opt) {
size_t N = yyjson_get_len(features);
SEXP vec_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, (R_xlen_t)N));
yyjson_arr_iter feature_iter = yyjson_arr_iter_with(features);
yyjson_val *feature_obj;
unsigned int idx = 0;
while ((feature_obj = yyjson_arr_iter_next(&feature_iter))) {
yyjson_val *props_obj = yyjson_obj_get(feature_obj, "properties");
yyjson_val *prop_val = yyjson_obj_get(props_obj, prop_name);
SET_STRING_ELT(vec_, idx, prop_to_rchar(prop_val, opt));
idx++;
}
UNPROTECT(1);
return vec_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Parse a property as a character string from a feature collection
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP prop_to_vecsxp(yyjson_val *features, char *prop_name, geo_parse_options *opt) {
size_t N = yyjson_get_len(features);
SEXP vec_ = PROTECT(allocVector(VECSXP, (R_xlen_t)N));
yyjson_arr_iter feature_iter = yyjson_arr_iter_with(features);
yyjson_val *feature_obj;
unsigned int idx = 0;
while ((feature_obj = yyjson_arr_iter_next(&feature_iter))) {
yyjson_val *props_obj = yyjson_obj_get(feature_obj, "properties");
yyjson_val *prop_val = yyjson_obj_get(props_obj, prop_name);
if (prop_val == NULL) {
SET_VECTOR_ELT(vec_, idx, ScalarLogical(NA_LOGICAL));
} else {
SET_VECTOR_ELT(vec_, idx, json_as_robj(prop_val, opt->parse_opt));
}
idx++;
}
UNPROTECT(1);
return vec_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Parse a property as a INTSXP from a feature collection
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP prop_to_lglsxp(yyjson_val *features, char *prop_name, geo_parse_options *opt) {
size_t N = yyjson_get_len(features);
SEXP vec_ = PROTECT(allocVector(LGLSXP, (R_xlen_t)N));
int *ptr = INTEGER(vec_);
yyjson_arr_iter feature_iter = yyjson_arr_iter_with(features);
yyjson_val *feature_obj;
while ((feature_obj = yyjson_arr_iter_next(&feature_iter))) {
yyjson_val *props_obj = yyjson_obj_get(feature_obj, "properties");
yyjson_val *prop_val = yyjson_obj_get(props_obj, prop_name);
if (prop_val == NULL) {
*ptr++ = NA_INTEGER;
} else {
*ptr++ = yyjson_get_bool(prop_val);
}
}
UNPROTECT(1);
return vec_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Parse a property as a INTSXP from a feature collection
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP prop_to_intsxp(yyjson_val *features, char *prop_name, geo_parse_options *opt) {
size_t N = yyjson_get_len(features);
SEXP vec_ = PROTECT(allocVector(INTSXP, (R_xlen_t)N));
int *ptr = INTEGER(vec_);
yyjson_arr_iter feature_iter = yyjson_arr_iter_with(features);
yyjson_val *feature_obj;
while ((feature_obj = yyjson_arr_iter_next(&feature_iter))) {
yyjson_val *props_obj = yyjson_obj_get(feature_obj, "properties");
yyjson_val *prop_val = yyjson_obj_get(props_obj, prop_name);
if (prop_val == NULL) {
*ptr++ = NA_INTEGER;
} else {
*ptr++ = yyjson_get_int(prop_val);
}
}
UNPROTECT(1);
return vec_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Parse a property as a REALSXP from a feature collection
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP prop_to_realsxp(yyjson_val *features, char *prop_name, geo_parse_options *opt) {
size_t N = yyjson_get_len(features);
SEXP vec_ = PROTECT(allocVector(REALSXP, (R_xlen_t)N));
double *ptr = REAL(vec_);
yyjson_arr_iter feature_iter = yyjson_arr_iter_with(features);
yyjson_val *feature_obj;
while ((feature_obj = yyjson_arr_iter_next(&feature_iter))) {
yyjson_val *props_obj = yyjson_obj_get(feature_obj, "properties");
yyjson_val *prop_val = yyjson_obj_get(props_obj, prop_name);
if (prop_val == NULL) {
*ptr++ = NA_REAL;
} else {
*ptr++ = yyjson_get_num(prop_val);
}
}
UNPROTECT(1);
return vec_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Forward declaration
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP parse_geometry_type(yyjson_val *val, geo_parse_options *opt);
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Parse a feature
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP parse_feature(yyjson_val *obj, geo_parse_options *opt) {
// Rprintf(">>> Feature\n");
reset_bbox(opt);
int nprotect = 0;
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Parse GEOMETRY
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
yyjson_val *geom = yyjson_obj_get(obj, "geometry");
SEXP geom_col_ = PROTECT(allocVector(VECSXP, 1)); nprotect++;
SEXP geom_ = PROTECT(parse_geometry_type(geom, opt)); nprotect++;
SET_VECTOR_ELT(geom_col_, 0, geom_);
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Set attributes on geometry
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
setAttrib(geom_col_, mkString("n_empty") , ScalarInteger(0));
setAttrib(geom_col_, mkString("crs") , make_crs());
SEXP geom_class_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 2)); nprotect++;
yyjson_val *geom_type = yyjson_obj_get(geom, "type");
// Rprintf("parse_geometry_type(): %s\n", yyjson_get_str(geom_type));
if (yyjson_equals_str(geom_type, "Point")) {
SET_STRING_ELT(geom_class_, 0, mkChar("sfc_POINT"));
} else if (yyjson_equals_str(geom_type, "MultiPoint")) {
SET_STRING_ELT(geom_class_, 0, mkChar("sfc_MULTIPOINT"));
} else if (yyjson_equals_str(geom_type, "LineString")) {
SET_STRING_ELT(geom_class_, 0, mkChar("sfc_LINESTRING"));
} else if (yyjson_equals_str(geom_type, "MultiLineString")) {
SET_STRING_ELT(geom_class_, 0, mkChar("sfc_MULTILINESTRING"));
} else if (yyjson_equals_str(geom_type, "Polygon")) {
SET_STRING_ELT(geom_class_, 0, mkChar("sfc_POLYGON"));
} else if (yyjson_equals_str(geom_type, "MultiPolygon")) {
SET_STRING_ELT(geom_class_, 0, mkChar("sfc_MULTIPOLYGON"));
} else {
SET_STRING_ELT(geom_class_, 0, mkChar("sfc_UNKNOWN"));
}
SET_STRING_ELT(geom_class_, 1, mkChar("sfc"));
setAttrib(geom_col_, R_ClassSymbol, geom_class_);
setAttrib(geom_col_, mkString("precision"), ScalarReal(0));
setAttrib(geom_col_, mkString("bbox"), make_bbox(opt));
if (opt->type == SFC_TYPE) {
// only care about geom, not properties.
UNPROTECT(nprotect);
return(geom_col_);
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Properties
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
yyjson_val *props = yyjson_obj_get(obj, "properties");
size_t ncols = yyjson_get_len(props) + 1;
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Allocate space for data.frame columns and column names
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP res_ = PROTECT(allocVector(VECSXP, (R_xlen_t)ncols)); nprotect++;
SEXP nms_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, (R_xlen_t)ncols)); nprotect++;
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Iterate over the keys/values "properties"
// keys become column names
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
yyjson_obj_iter iter = yyjson_obj_iter_with(props);
yyjson_val *val, *key;
unsigned int idx = 0;
while ((key = yyjson_obj_iter_next(&iter))) {
val = yyjson_obj_iter_get_val(key);
SEXP robj_ = PROTECT(json_as_robj(val, opt->parse_opt));
if (isNull(robj_)) {
// compatibilty with geojson: promotes NULL values to NA_character_
UNPROTECT(1);
robj_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 1));
SET_STRING_ELT(robj_, 0, NA_STRING);
} else if (isNewList(robj_) && length(robj_) == 0) {
// compatibilty with geojson. promote empty list to "{}"
UNPROTECT(1);
robj_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 1));
SET_STRING_ELT(robj_, 0, mkChar("{}"));
} else if (isNewList(robj_) && opt->property_promotion == PROP_TYPE_STRING) {
// this is either a list or a multi-element {}-objet or []-array
// so turn it back into a string
UNPROTECT(1);
robj_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 1));
SET_STRING_ELT(robj_, 0, prop_to_rchar(val, opt));
} else if (length(robj_) > 1 && opt->property_promotion == PROP_TYPE_STRING) {
// this is either a list or a multi-element {}-objet or []-array
// so turn it back into a string
UNPROTECT(1);
robj_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 1));
SET_STRING_ELT(robj_, 0, prop_to_rchar(val, opt));
}
SET_VECTOR_ELT(res_, idx, robj_);
UNPROTECT(1);
SET_STRING_ELT(nms_, idx, mkChar(yyjson_get_str(key)));
idx++;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// The geometry column should be a list (i.e. VECSXP)
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SET_VECTOR_ELT(res_, (R_xlen_t)ncols - 1, geom_col_);
SET_STRING_ELT(nms_, (R_xlen_t)ncols - 1, mkChar("geometry"));
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Set column names
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
setAttrib(res_, R_NamesSymbol, nms_);
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Row.names
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP rownames = PROTECT(allocVector(INTSXP, 2)); nprotect++;
SET_INTEGER_ELT(rownames, 0, NA_INTEGER);
SET_INTEGER_ELT(rownames, 1, -1); // only a single rows
setAttrib(res_, R_RowNamesSymbol, rownames);
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Nominate the geometry column name.
// Store this as the 'sf_geometry' attribute
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP sf_name_ = PROTECT(mkString("geometry")); nprotect++;
setAttrib(res_, mkString("sf_column"), sf_name_);
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Set 'data.frame' class
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
SEXP df_names_ = PROTECT(allocVector(STRSXP, 2)); nprotect++;
SET_STRING_ELT(df_names_, 0, mkChar("sf"));
SET_STRING_ELT(df_names_, 1, mkChar("data.frame"));
setAttrib(res_, R_ClassSymbol, df_names_);
UNPROTECT(nprotect);
return res_;
}
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// Accumulating types and names for properies should really be dynamic,
// but for first draft, just set a static upper limit on number of properiies.
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
#define MAX_PROPS 256
//===========================================================================
// ##### # ### ## ##
// # # # # # #
// # ### ### #### # # # ## ### # ### # #
// #### # # # # # # ## # # # # # # # #
// # ##### #### # # # # ##### # # # # #
// # # # # # # # ## # # # # # # # #
// # ### #### ## ## # # ### ### ### ### ###
//===========================================================================
SEXP parse_feature_collection_geometry(yyjson_val *features, geo_parse_options *opt) {
int nprotect = 0;
reset_bbox(opt);
if (!yyjson_is_arr(features)) {
error("Expecting FeatureCollection::features to be an array");
}
size_t nrows = yyjson_get_len(features);
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
// List-column will be used for geometry
//~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~