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DNAをPCRで増幅する

Phusion High-Fidelity PCR Master Mix with HF Buffer
Protocol (English)

概要

  • PCR(ポリメラーゼ連鎖反応)を用いて、特定のDNA断片だけを選択的に増幅させることができます

準備するもの

材料

  • 鋳型DNA
  • PCRマスターミックス(DNAポリメラーゼ、バッファー、dNTP含む)
  • プライマー(フォワードとリバースのセット)

消耗品

  • ヌクレアーゼフリー水、精製水
  • 0.2ml PCRチューブ
  • アイスボックス

機材

  • マイクロフュージ
  • マイクロピペット・ピペットチップ(1-10μl)
  • サーマルサイクラー(Bento Labなど)

手順

1. プライマーを設計します

2. サーマルサイクラーの設定をします

ステップ 温度 時間
1. 最初の熱変性 98°C 30秒
2. 熱変性 98°C 10秒
3. アニーリング 45-72°C 30秒
4. 伸長 72°C 30秒
5. 最後の伸長 72°C 300秒(5分)
6. ホールド 15°C -

※2-4のステップを25-35サイクル繰り返す

アニーリング温度の計算には「NEB Tm Calculator」などを使用します

3. 反応液を調製します

  • PCRに必要な試薬類は、使用前に冷凍庫から取り出して、氷上に立てておきます

  • 特に、PCRマスターミックスやプライマーは凍結していますので、室温で溶かし、よく混合してから氷上に立てておきます

  • すべての試薬類は使用前にマイクロフュージで軽くスピンダウンしておきます

  • 0.2ml PCRチューブの中に、以下の試薬を順に入れていき、緩やかなピペッティング、または軽くタッピングして混合します

  • チューブ内に溶液が飛散している場合は、マイクロフュージでスピンダウンします

試薬 分量
2X PCRマスターミックス 10 μl
精製水 7 μl
10μM フォワードプライマー 1 μl
10μM リバースプライマー 1 μl
鋳型DNA 1 μl
20 μl

4. PCRを開始します

  • サーマルサイクラーに、反応液を調製した0.2ml PCRチューブをセットして、PCRを開始します