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title: "中南大学 - 生物医学信息系课程"
subtitle: "Department of Biomedical Informatics, Central South University"
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# 生物医学信息系课程

## Biomedical Informatics Courses

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中南大学 · 生物医学信息系 · 本科生/研究生课程
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::: {.mt-4}
[查看课程列表](#courses){.btn .btn-light .btn-lg .me-2}
[📚 学习资源](learning-resources.qmd){.btn .btn-info .btn-lg .me-2}
[实验室主页](https://wanglabcsu.github.io/){.btn .btn-outline-light .btn-lg}
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## 授课教师 {.text-center .mb-5}

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::: {.instructor-avatar style="width: 120px; height: 120px; overflow: hidden; padding: 0;"}
![](logo/wsx.jpeg){style="width: 100%; height: 100%; object-fit: cover;"}
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### 王诗翔 副教授

**中南大学 · Department of Biomedical Informatics**

研究方向：生物信息学、计算生物学、多组学数据分析

🌐 [实验室主页](https://wanglabcsu.github.io/)
📧 wangshx@csu.edu.cn
🐙 [WangLabCSU](https://github.com/WangLabCSU)
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## 课程列表 {#courses .text-center .mt-5 .mb-4}

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### 📊 R与(R)Markdown基础

**学时**: 4学时（理论2 + 实验2）
**对象**: 生物医学信息系 本科生/研究生

掌握R语言核心语法与可重复性研究报告撰写技能。

- R语言基础（数据类型、控制流、函数）
- tidyverse数据处理与ggplot2可视化
- R Markdown与Quarto报告编写

[进入课程](r-and-rmarkdown/index.html){.btn .btn-primary .btn-sm .mt-2}
[查看幻灯片](r-and-rmarkdown/slides/slides-r-basics.html){.btn .btn-outline-primary .btn-sm .mt-2}
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### 🧬 转录组数据分析

**学时**: 4学时（理论2 + 实验2）
**对象**: 生物医学信息系 本科生/研究生

RNA-seq数据处理与差异表达分析。

- RNA-seq原理与流程
- DESeq2/edgeR差异分析
- 功能富集与通路分析

[进入课程](rna-seq-analysis/index.html){.btn .btn-primary .btn-sm .mt-2}
[查看幻灯片](rna-seq-analysis/slides/slides-rnaseq-overview.html){.btn .btn-outline-primary .btn-sm .mt-2}
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### 🧬 基因组突变分析

**学时**: 4学时（理论2 + 实验2）
**对象**: 生物医学信息系 本科生/研究生

基因组突变数据处理与突变特征分析。

- 突变类型与检测方法
- maftools数据可视化
- Sigminer突变特征分析

[进入课程](mutation-analysis/index.html){.btn .btn-primary .btn-sm .mt-2}
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## 课程特色 {.mt-5}

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#### 🎯 面向实战
所有内容紧密结合生物医学研究场景，代码示例可直接用于实际项目
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#### 🔗 前后衔接
课程体系完整，从基础到进阶，循序渐进
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#### 📚 资源丰富
提供完整的幻灯片、实验指导、示例代码、拓展阅读材料
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#### 🚀 现代工具
基于 Quarto 构建，支持多格式输出与在线交互
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## 使用说明 {.mt-5}

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### 如何使用本网站

1. **在线访问**: 直接点击课程卡片进入学习
2. **幻灯片浏览**: 每门课程配有交互式幻灯片，适合课堂展示
3. **实验指导**: 详细的实验手册，含完整参考答案
4. **离线使用**: 可下载完整网站到本地或机房使用
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::: {.callout-note}
### 技术栈

- **构建工具**: [Quarto](https://quarto.org/)
- **编程语言**: R, Python
- **托管平台**: GitHub Pages
- **源码地址**: [GitHub](https://github.com/WangLabCSU/courses)
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**中南大学 · Department of Biomedical Informatics**
*Central South University*

本网站使用 [Quarto](https://quarto.org) 构建 ·
[GitHub 仓库](https://github.com/WangLabCSU/courses) ·
[实验室主页](https://wanglabcsu.github.io/)

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