Stage is Non-integer

[DarioS]

For METABRIC data, something corrupting has happened to Stage covariate.

> clinical <- read.delim("NIHMS1520488-supplement-Supp_Table_5.txt")
> table(clinical$Stage) # Integers, as expected.
   0    1    2    3    4 
  13  795 1377  178   11
> spe <- spe_Ali_2020()
> table(spe$Stage)
                0 0.890826984126984 0.920203414332934 0.996466666666667                 1  1.02546666666667 
             1189               642               963              1661             79875                49 
 1.89227777777778   1.9412917184265  1.95033333333333            1.9505  1.97603333333333            1.9825 
              458               622              1161               654               568               747 
                2  2.00313333333333  2.00473333333333  2.00686666666667   2.0108908045977  2.04256666666667 
           294005               367              1433               548              1437               150 
 2.06826666666667                 3                 4 
              309             39460              6703