Uma ferramenta que auxilia e facilita pesquisadores da área a realizá comparações, de diversos modos, entre genomas e de ter os melhores tipos de visualização dos resultados obtidos pela ferramenta.
A ferramenta está desenvolvida na linguagem python, versão 3.0, e utiliza diversas bibliotecas externas. Para que a ferramenta rode em seu Linux é necessário ter instalado o python e suas respectivas bibliotecas, mostrado abaixo;
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Primeiro passo, instale o Python 3.0:
sudo apt-get install python3 -
Segundo passo, instalar o gerenciador de pacotes do python 3.0:
sudo apt-get install python3-pip -
Instale o BLAST, software licenciada pela NCBi, para realização de comparações genomicas de alta capacidade:
sudo apt install ncbi-blast+ -
Instale algumas ferramentas do NCBI: (OPCIONAL)
sudo apt install ncbi-tools-bin
Crie uma venv:
python -m venv venv
Ative a venv:
source venv/bin/activate
Instale as dependencias do projeto:
pip3 install -r requirements.txt
Percorra pelo terminal até a pasta na qual está situado a ferramenta, então execute o seguinte comando:
python3 GeMapCom.py
Nota: Para qualquer auxílio com o funcionamento da ferramenta, é só acessar a pasta Manual, na qual contém o manual de uso da ferramenta.
- Romuere Rodrigues Veloso e Silva
- Pedro Azevedo Abrantes de Oliveira
- Francisco das Chagas dos Anjos Carvalho Júnior