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<title>Identification des habitats potentiels des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent - Variables environnementales</title>
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<nav id="TOC" role="doc-toc" class="toc-active">
<h2 id="toc-title">Table of contents</h2>
<ul>
<li><a href="#connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-de-mer" id="toc-connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-de-mer" class="nav-link active" data-scroll-target="#connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-de-mer">Connaissances sur les habitats des plumes de mer</a></li>
<li><a href="#listes-des-variables-environnementales-présentées" id="toc-listes-des-variables-environnementales-présentées" class="nav-link" data-scroll-target="#listes-des-variables-environnementales-présentées">Listes des variables environnementales présentées</a>
<ul class="collapse">
<li><a href="#fonds-marins" id="toc-fonds-marins" class="nav-link" data-scroll-target="#fonds-marins">Fonds marins</a></li>
<li><a href="#eaux-de-surface" id="toc-eaux-de-surface" class="nav-link" data-scroll-target="#eaux-de-surface">Eaux de surface</a></li>
</ul></li>
</ul>
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<div class="quarto-title">
<h1 class="title d-none d-lg-block">Variables environnementales</h1>
</div>
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</div>
</header>
<section id="connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-de-mer" class="level2 page-columns page-full">
<h2 class="anchored" data-anchor-id="connaissances-sur-les-habitats-des-plumes-de-mer">Connaissances sur les habitats des plumes de mer</h2>
<p>Les connaissances sur les habitats des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent sont limitées à ce jour. Les travaux de <span class="citation" data-cites="kenchington2016">Kenchington et al. (<a href="references.html#ref-kenchington2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span> ont permis de délimiter des zones d’importance pour les plumes de mer avec la méthode du noyau dans le golfe du Saint-Laurent. Ces zones, où la concentration de plumes de mer est particulièrement élevée, se situent le long du chenal Laurentien <a href="#fig-zones-sea-pens">Figure <span>1</span></a>.</p>
<div id="fig-zones-sea-pens" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full">
<p><img src="figures/sea_pens_areas.png" class="img-fluid figure-img"></p>
<p></p><figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure 1: Zones de concentration significative de plumes de mer dans le golfe du Saint-Laurent identifiées par <span class="citation" data-cites="kenchington2016">Kenchington et al. (<a href="references.html#ref-kenchington2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span></figcaption><p></p>
</figure>
</div>
<p>Ces polygones ont été complémentés par des modèles de distribution des plumes de mer dans le golfe du Saint-Laurent réalisés par <span class="citation" data-cites="murillo2016">Murillo et al. (<a href="references.html#ref-murillo2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span>. Les modèles basés sur des arbres décisionnels ont permis d’identifier la salinité et la température des eaux de fond ainsi que la profondeur comme étant les variables environnementales les plus importantes pour la prédiction de la présence des plumes de mer <span class="citation" data-cites="murillo2016">(<a href="references.html#ref-murillo2016" role="doc-biblioref">Murillo et al. 2016</a>)</span>. La productivité primaire et la température des eaux de surface sont quant à elles les deux variables environnementales les plus importantes pour la prédiction de la biomasse des plumes de mer <span class="citation" data-cites="murillo2016">(<a href="references.html#ref-murillo2016" role="doc-biblioref">Murillo et al. 2016</a>)</span>.</p>
<p>D’autres modèles de distribution des plumes de mer ont été réalisés pour complémenter les travaux de <span class="citation" data-cites="kenchington2016">Kenchington et al. (<a href="references.html#ref-kenchington2016" role="doc-biblioref">2016</a>)</span>. Ces modèles visent la région des Maritimes <span class="citation" data-cites="beazley2016a">(<a href="references.html#ref-beazley2016a" role="doc-biblioref">Beazley, Kenchington, et al. 2016</a>)</span>, les plates-formes de Terre-Neuve et du Labrador <span class="citation" data-cites="guijarro2016">(<a href="references.html#ref-guijarro2016" role="doc-biblioref">Guijarro et al. 2016</a>)</span> et l’est de l’Arctique <span class="citation" data-cites="beazley2016b">(<a href="references.html#ref-beazley2016b" role="doc-biblioref">Beazley, Murillo, et al. 2016</a>)</span>. La profondeur est une variable importante pour la prédiction de la présence des plumes de mer dans ces trois régions <span class="citation" data-cites="beazley2016a beazley2016b guijarro2016">(<a href="references.html#ref-beazley2016a" role="doc-biblioref">Beazley, Kenchington, et al. 2016</a>; <a href="references.html#ref-beazley2016b" role="doc-biblioref">Beazley, Murillo, et al. 2016</a>; <a href="references.html#ref-guijarro2016" role="doc-biblioref">Guijarro et al. 2016</a>)</span>, alors que l’étendue des valeurs de la salinité des eaux de fond s’est également avérée importante pour le modèle dans l’est de l’Arctique <span class="citation" data-cites="guijarro2016">(<a href="references.html#ref-guijarro2016" role="doc-biblioref">Guijarro et al. 2016</a>)</span>.</p>
<p>Nous nous sommes également fiés sur d’autres études portant sur la distribution et les habitats des plumes de mer ailleurs dans le monde afin d’élaborer la liste de variables à prendre en considération pour les modèles. La <a href="#tbl-studies">Table <span>1</span></a> présente un résumé de ces études avec les taxons visés, l’aire d’étude et les variables les plus importantes pour la prédiction de la présence des plumes de mer.</p>
<div id="tbl-studies" class="anchored">
<table class="table">
<caption>Table 1: Variables environnementales les plus importantes pour la prédiction de la présence des plumes de mer selon cinq études aillant modélisé leurs distributions</caption>
<colgroup>
<col style="width: 16%">
<col style="width: 29%">
<col style="width: 31%">
<col style="width: 22%">
</colgroup>
<thead>
<tr class="header">
<th>Études</th>
<th>Taxons visés</th>
<th>Aires d’étude</th>
<th>Variables</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr class="odd">
<td><span class="citation" data-cites="gullage2017">Gullage, Devillers, and Edinger (<a href="references.html#ref-gullage2017" role="doc-biblioref">2017</a>)</span></td>
<td>- <em>Distichophyllum gracile</em> <br> - <em>Funiculina quadrangularis</em> <br> - <em>Halipteris finmarchica</em> <br> - <em>Pennatula grandis</em> <br> - <em>Pennatula aculeata</em> <br> - <em>Pennatula</em> spp. <br> - <em>Umbellula lindahli</em> <br> - <em>Anthoptilum grandiflorum</em></td>
<td>Plates-formes de Terre-Neuve et du Labrador</td>
<td>- Profondeur <br> - Température des eaux de fond</td>
</tr>
<tr class="even">
<td><span class="citation" data-cites="yesson2012">Yesson et al. (<a href="references.html#ref-yesson2012" role="doc-biblioref">2012</a>)</span></td>
<td>- Sessiliflorae <br> - Subselliflorae</td>
<td>Globale</td>
<td>- Température des eaux de fond <br> - Productivité primaire des eaux de surface <br> - Horizons de saturation en calcite <br> - Salinité des eaux de fond</td>
</tr>
<tr class="odd">
<td><span class="citation" data-cites="greathead2015">Greathead et al. (<a href="references.html#ref-greathead2015" role="doc-biblioref">2015</a>)</span></td>
<td>- <em>Funiculina quadrangularis</em> <br> - <em>Virgularia mirabilis</em> <br> - <em>Pennatula phosphorea</em></td>
<td>Royaume-Uni</td>
<td>- Sédiments <br> - Salinité minimale des eaux de fond <br> - Profondeur</td>
</tr>
<tr class="even">
<td><span class="citation" data-cites="downie2021">Downie et al. (<a href="references.html#ref-downie2021" role="doc-biblioref">2021</a>)</span></td>
<td>- <em>Funiculina quadrangularis</em> <br> - <em>Virgularia mirabilis</em> <br> - <em>Pennatula phosphorea</em></td>
<td>Royaume-Uni</td>
<td>- Température des eaux de fond <br> - Vélocité du courant et des vagues <br> - Concentration de particules en suspension en hiver</td>
</tr>
<tr class="odd">
<td><span class="citation" data-cites="ross2021">Ross et al. (<a href="references.html#ref-ross2021" role="doc-biblioref">2021</a>)</span></td>
<td>- <em>Funiculina quadrangularis</em> <br> - <em>Halipteris</em> spp. <br> - <em>Kophobelemnon stelliferum</em> <br> - <em>Pennatulidae</em> spp. <br> - <em>Umbellula</em> spp. <br> - <em>Virgulariidae</em> spp.</td>
<td>Norvège</td>
<td>- Profondeur <br> - Interaction Température-Salinité <br> - Sédiments <br> - Pente <br> - Vélocité maximale du courant <br> - Biomasse de carbone du phytoplancton</td>
</tr>
</tbody>
</table>
</div>
</section>
<section id="listes-des-variables-environnementales-présentées" class="level2">
<h2 class="anchored" data-anchor-id="listes-des-variables-environnementales-présentées">Listes des variables environnementales présentées</h2>
<p>En raison de l’état des connaissances relativement limitée sur les habitats des plumes de mer dans l’estuaire maritime et le golfe du Saint-Laurent, il est préférable d’explorer un grand nombre de variables environnementales avant de commencer la modélisation afin d’éviter d’exclure une variable potentiellement importante dès le départ. Les prochaines sections présentent les 61 variables intégrées jusqu’à présent pour modéliser les habitats potentiels des plumes de mer.</p>
<p>Les données présentées proviennent de Pêches et Océans Canada ainsi que de Bio-Oracle. Les données ont toutes été projetées sur une grille de 36 secondes d’arc de résolution, à l’exception des données de sédiments puisqu’elles sont sous forme de polygones.</p>
<p>Il est important de noter que cette liste n’est pas exhaustive et que d’autres variables pourraient y être ajoutées éventuellement.</p>
<section id="fonds-marins" class="level3">
<h3 class="anchored" data-anchor-id="fonds-marins">Fonds marins</h3>
<ul>
<li><p>Bathymétrie et pente</p></li>
<li><p>Oxygène dissous dans les eaux de fond</p></li>
<li><p>Salinité des eaux de fond</p></li>
<li><p>Température des eaux de fond</p></li>
<li><p>Vitesse du courant</p></li>
<li><p>Biomasse de phytoplancton et concentration de chlorophylle a</p></li>
<li><p>Concentration de molécules et éléments dissous dans les eaux de fond</p></li>
<li><p>Sédiments</p></li>
<li><p>Données sur la pêche commerciale</p></li>
</ul>
</section>
<section id="eaux-de-surface" class="level3">
<h3 class="anchored" data-anchor-id="eaux-de-surface">Eaux de surface</h3>
<ul>
<li><p>Couvert glacier</p></li>
<li><p>Biomasse de phytoplancton, concentration de chlorophylle a et productivité primaire</p></li>
<li><p>Calcite dissous dans les eaux de surface</p></li>
</ul>
<div id="refs" class="references csl-bib-body hanging-indent" role="doc-bibliography" style="display: none">
<div id="ref-beazley2016a" class="csl-entry" role="doc-biblioentry">
Beazley, L, E Kenchington, F. J. Murillo, C Lirette, J Guijarro, A McMillan, and A Knudby. 2016. <span>“Species <span>Distribution Modelling</span> of <span>Corals</span> and <span>Sponges</span> in the <span>Maritimes Region</span> for <span>Use</span> in the <span>Identification</span> of <span>Significant Benthic Areas</span>.”</span> <em>Canadian Technical Report of Fisheries and Aquatic Sciences</em>, no. 3172: vi + 189p.
</div>
<div id="ref-beazley2016b" class="csl-entry" role="doc-biblioentry">
Beazley, L, F. J. Murillo, E Kenchington, J Guijarro, C Lirette, T Siferd, M Treble, E Baker, M Bouchard Marmen, and G Tompkins MacDonald. 2016. <span>“Species <span>Distribution Modelling</span> of <span>Corals</span> and <span>Sponges</span> in the <span>Eastern Arctic</span> for <span>Use</span> in the <span>Identification</span> of <span>Significant Benthic Areas</span>.”</span> <em>Canadian Technical Report of Fisheries and Aquatic Sciences</em> 3175: vii + 210p.
</div>
<div id="ref-downie2021" class="csl-entry" role="doc-biblioentry">
Downie, Anna-Leena, Tamsyn Noble-James, Ana Chaverra, and Kerry L. Howell. 2021. <span>“Predicting Sea Pen (<span>Pennatulacea</span>) Distribution on the <span>UK</span> Continental Shelf: Evidence of Range Modification by Benthic Trawling.”</span> <em>Marine Ecology Progress Series</em> 670 (July): 75–91. <a href="https://doi.org/10.3354/meps13744">https://doi.org/10.3354/meps13744</a>.
</div>
<div id="ref-greathead2015" class="csl-entry" role="doc-biblioentry">
Greathead, C., J. M. González-Irusta, J. Clarke, P. Boulcott, L. Blackadder, A. Weetman, and P. J. Wright. 2015. <span>“Environmental Requirements for Three Sea Pen Species: Relevance to Distribution and Conservation.”</span> <em>ICES Journal of Marine Science</em> 72 (2): 576–86. <a href="https://doi.org/10.1093/icesjms/fsu129">https://doi.org/10.1093/icesjms/fsu129</a>.
</div>
<div id="ref-guijarro2016" class="csl-entry" role="doc-biblioentry">
Guijarro, J, L Beazley, C Lirette, E Kenchington, V Wareham, K Gilkinson, M Koen-Alonso, and F. J. Murillo. 2016. <span>“Species <span>Distribution Modelling</span> of <span>Corals</span> and <span>Sponges</span> from <span>Research Vessel Survey Data</span> in the <span>Newfoundland</span> and <span>Labrador Region</span> for <span>Use</span> in the <span>Identification</span> of <span>Significant Benthic Areas</span>.”</span> <em>Canadian Technical Report of Fisheries and Aquatic Sciences</em> 3171: vi + 126p.
</div>
<div id="ref-gullage2017" class="csl-entry" role="doc-biblioentry">
Gullage, Lauren, Rodolphe Devillers, and Evan Edinger. 2017. <span>“Predictive Distribution Modelling of Cold-Water Corals in the <span>Newfoundland</span> and <span>Labrador</span> Region.”</span> <em>Marine Ecology Progress Series</em> 582 (November): 57–77. <a href="https://doi.org/10.3354/meps12307">https://doi.org/10.3354/meps12307</a>.
</div>
<div id="ref-kenchington2016" class="csl-entry" role="doc-biblioentry">
Kenchington, E, L Beazley, C Lirette, F J Murillo, J Guijarro, V Wareham, K Gilkinson, et al. 2016. <span>“Delineation of <span>Coral</span> and <span>Sponge Significant Benthic Areas</span> in <span>Eastern Canada Using Kernel Density Analyses</span> and <span>Species Distribution Models</span>.”</span> <em>DFO Canadian Science Advisory Secretariat Research Document</em> 2016/093: vi + 178p.
</div>
<div id="ref-murillo2016" class="csl-entry" role="doc-biblioentry">
Murillo, F J, E Kenchington, L Beazley, C Lirette, A Knudby, J Guijarro, H Benoît, H Bourdages, and B Sainte-Marie. 2016. <span>“Distribution <span>Modelling</span> of <span>Sea Pens</span>, <span>Sponges</span>, <span>Stalked Tunicates</span> and <span>Soft Corals</span> from <span>Research Vessel Survey Data</span> in the <span>Gulf</span> of <span>St</span>. <span>Lawrence</span> for <span>Use</span> in the <span>Identification</span> of <span>Significant Benthic Areas</span>.”</span> <em>Canadian Technical Report of Fisheries and Aquatic Sciences</em>, no. 3170: vi + 132.
</div>
<div id="ref-ross2021" class="csl-entry" role="doc-biblioentry">
Ross, Rebecca E., Genoveva Gonzalez-Mirelis, Pablo Lozano, and Pål Buhl-Mortensen. 2021. <span>“Discerning the <span>Management-Relevant Ecology</span> and <span>Distribution</span> of <span>Sea Pens</span> (<span>Cnidaria</span>: <span>Pennatulacea</span>) in <span>Norway</span> and <span>Beyond</span>.”</span> <em>Frontiers in Marine Science</em> 8.
</div>
<div id="ref-yesson2012" class="csl-entry" role="doc-biblioentry">
Yesson, Chris, Michelle L. Taylor, Derek P. Tittensor, Andrew J. Davies, John Guinotte, Amy Baco, Julie Black, Jason M. Hall-Spencer, and Alex D. Rogers. 2012. <span>“Global Habitat Suitability of Cold-Water Octocorals.”</span> <em>Journal of Biogeography</em> 39 (7): 1278–92. <a href="https://doi.org/10.1111/j.1365-2699.2011.02681.x">https://doi.org/10.1111/j.1365-2699.2011.02681.x</a>.
</div>
</div>
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